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产品概述

二代真核转录组接纳Illumina测序平台,对有参、无参真核生物特定细胞在某一功效状态下转录的所有mRNA举行测序。在定量层面,有参可以对基因举行定量剖析,无参只能对Unigene(优化的转录本)举行定量剖析,并举行下游的差别基因剖析和功效注释等;在结构层面,有参可举行可变剪切、SNP剖析、基因结构优化、新基因展望。现在已普遍应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等领域。

应用偏向

  • 基础医学、临床诊断:生物标记物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
  • 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;
  • 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种;ぱ芯康;
  • 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业情形与水产品清静等。

手艺特点

  • 使用多种分子标签,可以在一个测序文库中同时检测大宗样品;

  • 富集转录本5 ‘端测序,阻止了3’端测序造成的难题,基因检出率高;

  • 可以与恣意标准文库同时上机,因此对测序量要求很是无邪;

  • 很是适用于大规模的差别表达剖析。

效果展示

GC含量漫衍

GC含量漫衍


Veen图

Veen图


GO注释

GO注释


KEGG代谢通路分类统计

KEGG代谢通路分类统计

样本类型

  • 组织、细胞、体液、总RNA;

样本要求

  • 细胞:2×106 ;
  • 组织:﹥50 mg;
  • 体液:全血、血清、血浆2-3 ml;脑脊液:5 ml;尿液:50 ml;
  • 总RNA:﹥2 μg(至少500ng)

应用案例

MOTS-c and exercise restore cardiac function by activating of NRG1-ErbB signaling in diabetic rats(Frontiers in Endocrinology,5.555)

MOTS-c和有氧运动通过激活NRG1-ErbB信号通路恢复糖尿病大鼠心脏功效

有氧运动和MOTS-c治疗均可显著镌汰糖尿病心脏结构和功效的异常;有氧运动和MOTS-c所改变的两组糖尿病致病基因其功效均富集于炎症、心肌细胞凋亡、血管天生和内皮细胞增殖三方面,其中NRG1-ErbB4通路可能是MOTS-c在恢复糖尿病心脏功效障碍方面的运动模拟效应的要害。本文的研究可能有助于更好地明确MOTS-c和有氧运动对糖尿病心脏舒张功效障碍的影响,并为MOTS-c改善糖尿病心脏舒张功效障碍的运动模拟分子机制翻开了新的思绪。

转录组数据差别基因剖析效果

转录组数据差别基因剖析效果


差别基因的功效富集剖析

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